Matplotlibの等高線図をオーバーレイ
クリス
2つのグループの2次元分布を比較する必要があります。
matplotlib.pyplot.contourfプロットを使用してオーバーレイすると、各等高線プロットの背景色がプロットスペース全体を塗りつぶします。各等高線プロットの最低等高線レベルを透明にして、各等高線の中心が見やすくする方法はありますか？
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib import cm
import scipy.stats as st
def make_cloud(x, y, std, n=100):
x = np.random.normal(x, std, n)
y = np.random.normal(y, std, n)
return np.array(zip(x, y))
def contour_cloud(x, y, cmap):
xmin, xmax = -4, 4
ymin, ymax = -4, 4
xx, yy = np.mgrid[xmin:xmax:100j, ymin:ymax:100j]
positions = np.vstack([xx.ravel(), yy.ravel()])
values = np.vstack([x, y])
kernel = st.gaussian_kde(values)
f = np.reshape(kernel(positions).T, xx.shape)
plt.contourf(xx, yy, f, cmap=cmap, alpha=0.5)
cloud1 = make_cloud(-1, 1, 1)
cloud2 = make_cloud(1, -1, 1)
plt.scatter(x=cloud1[:,0], y=cloud1[:,1])
plt.scatter(x=cloud2[:,0], y=cloud2[:,1], color='red')
fig = plt.gcf()
ax = plt.gca()
contour_cloud(x=cloud1[:, 0], y=cloud1[:, 1], cmap=cm.Blues)
contour_cloud(x=cloud2[:, 0], y=cloud2[:, 1], cmap=cm.Reds)
ダグラス・ドーソン
確認したいコントロールがいくつかありますcontourf。さまざまなレベルを手動で変更したり、仕様の上下にカラーマップを変更したりできます。デフォルトでは、最低レベルより下（または最大レベルより上）の領域の塗りつぶしは透明に見えます。
だから、あなたが欲しいものを行うための最も簡単な方法は、手動でレベルを指定し、そこにように、それらを指定することである最低レベル以下の点が、ありません、最高レベルの上の任意のポイント。
交換する場合：
plt.contourf(xx, yy, f, cmap=cmap, alpha=0.5)
と：
step = 0.02
m = np.amax(f)
levels = np.arange(0.0, m, step) + step
plt.contourf(xx, yy, f, levels, cmap=cmap, alpha=0.5)
次のような画像を生成します： 
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