在R中的相关矩阵上应用阈值

杰西

我目前正在使用R处理数据集。我为变量创建了相关性martix(Pearson)。但是现在我想为矩阵中显示的值设置一个阈值。我正在尝试以下代码:

cor_relation = cor(mydata_frame, use="all.obs", method="pearson")

我得到以下输出:

             200605_s_at      202592_at      202958_at
200605_s_at  1.000000000     0.295065389     0.169772244
202592_at    0.695065389     1.000000000     -0.534394180
202958_at    0.869772244     -0.534394180    1.000000000

我想找到以下输出(当我将阈值设置为0.6时):

             200605_s_at      202592_at      202958_at
200605_s_at  1.000000000        NA              NA
202592_at    0.695065389     1.000000000        NA
202958_at    0.869772244        NA           1.000000000

在此先感谢您的帮助!

布罗迪

备用:

cor_relation[abs(cor_relation) < 0.6] <- NA

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