我有一个文本文件，里面mart_export.txt充满了两种不同类型的键，看起来像这样
Gene stable ID RefSeq match transcript
ENSG00000243959
ENSG00000206698
ENSG00000265684
ENSG00000251990
ENSG00000241552
ENSG00000050767 NM_173465.4
如您所见，大多数右列都没有任何数据，但是我正尝试仅使用具有两列值的索引来构建新的pandas数据框。到目前为止，这是我的脚本
#Put the biomart export in a pandas dataframe
mart = pd.read_csv("mart_export.txt", delimiter="\t")
#Create new list of records with Gene Stable Id and RefSeq numbers
d = {'Gene Stable ID': [], 'RefSeq ID': []}
for i in mart:
if mart['RefSeq match transcript'] != NaN:
d['Gene Stable ID'].append(mart['Gene stable ID'])
d['RefSeq ID'].append(mart['RefSeq match transcript'])
在Spyder中，第二列中空白的值标记为NaN，但是当我尝试在代码中使用该值时，我在python中收到一条错误消息，指出未定义NaN。如何指定python的空白外观？
您可以使用dropna()pandas方法删除行或列DataFrame。
在您的情况下，它将是：
mart.dropna(axis="rows", inplace=True)
您可以删除包含NaNs的列，指定how参数等等，然后检查上面链接的文档。
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