使用R-INLA运行混合效果模型时的错误消息

亚历克斯

我正在使用R-INLA运行以下模型(Treatment,Animal.1和Animal.2是因子,Encounter.Length是连续的):

formula <- Encounter.Length ~ Treatment +f(Animal.1, model = "iid", n = n.animal) + 
           f(Animal.2, copy = "Animal.1")

m.1 <- inla(formula, data = inla.dat)

但是,运行此代码后,我收到以下错误消息:

inla(公式,数据= inla.dat)中的错误:在f(Animal.1)中:“协变量”必须与“值”匹配,并且两者都必须为“数字”或“因子” /“字符”。

我是使用INLA的新手,并且想知道此错误消息的含义以及如何解决。

亚历克斯

答案(来自r-inla.help):B级别不是A的子集(用于定义B副本的模型)。因此,您必须在级别上的并集上定义模型。

例如:

n <- 3 
A <- as.factor(letters[1:n]) 
B <- as.factor(letters[1+1:n]) 
y <- 1:n 

这行不通

inla(y ~ -1 + f(A) + f(B, copy = "A"), data = data.frame(A, B)) 

但这确实

values <- as.factor(unique(c(levels(A), levels(B)))) 
inla(y ~ -1 + f(A, values = values) + f(B, copy = "A"), 
data = list(A = A, B = B, values = values))

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