plink를 사용하여 .vcf 파일을 .ped 파일로 변환하려고합니다. 온라인에서 몇 가지 설명서와 게시물을 읽었지만 vcf를 ped로 변환하는 방법을 구체적으로 언급하는 사람은없는 것 같습니다.
나는 여기에 vcf를 ped로 변환하는 plink에 대한 경험이있는 전문가가있을 수 있기를 바랍니다. 지식을 공유해 주시면 감사하겠습니다. 또 다른 방법 (비플 링크)이 있다면 공유 해주세요.
감사합니다!
VCFtools를 사용하여 내 vcf 파일을 PLINK 형식 (ped, fam, map)으로 변환합니다 : https://vcftools.github.io/man_latest.html
내 명령은 다음과 같습니다.
vcftools --vcf my_data.vcf --out my_data --plink
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몇 마디 만하겠습니다