여러 데이터 세트가있는 R의 비선형 회귀

환자

나는 R을 배우고 있으며 현재 비선형 회귀에 사용하고 있습니다. 두 세트의 데이터 (다른 머신에서 작업 기간)가 있으며 이러한 각 세트에 대해 좋은 비선형 회귀를 찾을 수 있습니다. 이제 두 잔차 제곱합의 합을 최소화하는 최상의 회귀를 찾고 싶습니다.

내가 가진 것은 다음과 같습니다.

A <- c(1:5)
B <- c(100, 51, 32, 24, 19)
C <- c(150, 80, 58, 39, 29)

df <- data.frame (A,B,C)

f <- B ~ k1/A + k2
g <- C ~ k1/A + k2

n <- nls(f, data = df, start = list(k1=10, k2=10))
p <- nls(g, data = df, start = list(k1=10, k2=10))
n
#Nonlinear regression model
#  model: B ~ k1/A + k2
#   data: df
#     k1      k2 
#101.595  -1.195 
# residual sum-of-squares: 2.619

#Number of iterations to convergence: 1 
#Achieved convergence tolerance: 2.568e-07

p
#Nonlinear regression model
#  model: C ~ k1/A + k2
#   data: df
#     k1      k2 
#148.044   3.593 
# residual sum-of-squares: 54.19

#Number of iterations to convergence: 1 
#Achieved convergence tolerance: 1.803e-07

k1 및 k2 상수는 (물론) 두 세트 (B 및 C)에 대해 다릅니다. 두 데이터 세트에 대해 '최상의'솔루션을 생성하는 특정 k1과 특정 k2를 어떻게 찾을 수 있는지 궁금합니다.

내 설명이 이해할 수 있기를 바랍니다. 그렇지 않으면 내가 찾으려고하는 것은 때때로 (적어도 여기에서 ) 글로벌 비선형 회귀라고합니다.

편집 : 특정 매개 변수에 대해 음수 값을 피하기 위해 R에게 어떻게 말할 수 있는지 알고 싶습니다. 이 경우 k2를 양수로하고 싶습니다.

롤랑

동일한 매개 변수를 원하면 데이터를 풀링해야합니다.

df2 <- data.frame(Y=c(df$B,df$C), X=rep(df$A, 2))
p <- nls(Y ~ k1/X + k2, 
         data = df2, 
         start = list(k1=10, k2=10), 
         lower = c(0, 0), 
         algorithm = "port")
summary(p)

#  Formula: Y ~ k1/X + k2
#  
#  Parameters:
#    Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
#  k1  124.819     18.078   6.904 0.000124 ***
#    k2    1.199      9.781   0.123 0.905439    
#  ---
#    Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
#  
#  Residual standard error: 16.59 on 8 degrees of freedom
#  
#  Algorithm "port", convergence message: both X-convergence and relative convergence (5)

편집하다:

하나의 매개 변수를 동일하게하고 다른 하나는 다양하게하려면 혼합 효과 모델을 사용할 수 있습니다. 그러나 제약 조건을 지정하는 방법을 모르겠습니다 (간단한 작업은 아니지만 다시 매개 변수화를 통해 달성 할 수 있다고 생각합니다).

library(nlme)

library(reshape2)
df3 <- melt(df, id.vars="A")

r <- nlme(value ~ k1/A + k2, 
          data = df3, 
          start = c(k1=10, k2=10), 
          fixed = k1 + k2 ~1,
          random = k2 ~ 1|variable)

summary(r)
#  Nonlinear mixed-effects model fit by maximum likelihood
#  Model: value ~ k1/A + k2 
#  Data: df3 
#  AIC      BIC    logLik
#  83.11052 84.32086 -37.55526
#  
#  Random effects:
#    Formula: k2 ~ 1 | variable
#                k2 Residual
#  StdDev: 12.49915 7.991013
#  
#  Fixed effects: k1 + k2 ~ 1 
#         Value Std.Error DF   t-value p-value
#  k1 124.81916  9.737738  7 12.818086  0.0000
#  k2   1.19925 11.198211  7  0.107093  0.9177
#  Correlation: 
#         k1    
#  k2 -0.397
#  
#  Standardized Within-Group Residuals:
#    Min         Q1        Med         Q3        Max 
#  -1.7520706 -0.5273469  0.2746039  0.5235343  1.4971808 
#  
#  Number of Observations: 10
#  Number of Groups: 2 

coef(r)
#          k1        k2
#  B 124.8192 -10.81835
#  C 124.8192  13.21684

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