x 축에서 올바른 순서를 얻는 방법은 무엇입니까?

debugcn 에 게시 Dev

학생 24

x 축의 배율 순서에 문제가 있습니다.

다음은 x 축이 잘못된 상자 그림의 이미지입니다.

내 입력 파일은 두 데이터 프레임을 병합하고 일치시킨 후 올바른 순서를 갖습니다.

#data
Eisenberg <- data.frame(scale_hyd = c(0.62, 0.29, -0.9, -0.74, 1.19, 0.48, -0.4, 
                                      1.38, -1.5, 1.06, 0.64, -0.78, 0.12, -0.85, 
                                      -2.53, -0.18, -0.05, 1.08, 0.81, 0.26), 
                        aa = c('A','C','D','E','F','G','H','I','K','L','M','N',
                               'P','Q','R','S','T','V','W','Y'))

hydroph <- data.frame(position_aa = c("-10", "-9", "-8", "-7", "-6", "-5", "-4",
                                      "-3", "-2", "-1", "0", "1", "2", "3", "4",
                                      "5", "6", "7", "8", "9", "10", "11", "12",
                                      "13", "14"),
                      aa = c("C","V","Q","W","K","N","A","Y","A","L","C","W","L",
                             "D","C","I","L","S","A","L","V","H","S","E","E")) 



#combining data
res <- merge(Eisenberg, hydroph)

res1 <- res[match(hydroph$position_aa, res$position_aa), ]
view(res1)

#visualisation of data
ggplot(res1, aes(x=position_aa, y=scale_hyd)) +
  geom_boxplot() +
  labs(x="Amino acid position", y="Eisenberg scale", title="Hydrophobicity") +
  theme_bw() +
  theme(legend.position="none") +
     geom_dotplot(binaxis="y", stackdir="center", fill="black")

x 축에 position_aa의 올바른 순서를 지정하는 데 도움을 주시면 감사하겠습니다.

-10-9-8 ... 14

대신 : -1 -10 -2 ...

내가 추가 한 제안대로 res1$position_aa <- as.numeric(res1$position_aa)

변경 후 내 플롯은 다음과 같습니다.

jay.sf

이상하게도 패키지는 우리가 무엇을 하든지간에 어떻게 든 가치를 캐릭터로 되 돌리는 것 같습니다.

대신 기본 R 플롯을 시도해 볼 수 있습니다. 먼저 "factor"숫자 순서가 지정된 변수 가 필요 합니다.

res$position_aa <- factor(res$position_aa, levels=-10:14)

그런 다음 우리 가 제공 한 수준에 따라 적절하게 정렬 된 plot사용 graphics:::plot.factor방법 을 사용합니다 . 그 후 우리는 추가 points및 사용하여 그리드를 만들 abline. 그게 다야.

with(res, plot(position_aa, scale_hyd, main="Hydrophobicity",
               xlab="Amino acid position",
               ylab="Eisenberg scale"))
with(res, points(position_aa, scale_hyd, pch=16, cex=1.5))
.col <- rgb(0, 0, 0, .25)  ## alpha .25 for transparency
abline(h=axTicks(2), lty=3, col=.col)
abline(v=seq(-10:14), lty=3, col=.col)

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침해가 발생한 경우 연락 주시기 바랍니다[email protected] 삭제

에서 수정2021-04-5

몇 마디 만하겠습니다

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