R에서 for 루프를 사용하여 행렬의 각 행에 Wilcoxon 테스트를 적용하는 방법

debugcn 에 게시 Dev

sooo

저는 R을 처음 사용합니다. R 아래에서 행렬의 모든 행에 Wilcoxon 테스트를 적용하는 방법에 대한 빠른 질문이 있습니다. 예를 들어, 가장 간단한 행렬로. Wilcoxon 테스트를 for 루프, 두 그룹의 열, 그룹으로 1에서 5까지, 다른 그룹으로 6에서 10으로 모든 행에 적용하려고합니다. 그리고 P- 값을 파일에 열로 저장합니다. 두 개의 for 루프를 작성했지만 실패했습니다. 마지막에 for 루프와 오류 메시지를 넣었습니다. 정말 고맙습니다.

mymatrix
       [,1][,2] [,3]  [,4] [,5] [,6] [,7] [,8] [,9]  [,10]
 [1,]    1   11   21   31   41   51   61   71   81    91
 [2,]    2   12   22   32   42   52   62   72   82    92
 [3,]    3   13   23   33   43   53   63   73   83    93
 [4,]    4   14   24   34   44   54   64   74   84    94
 [5,]    5   15   25   35   45   55   65   75   85    95
 [6,]    6   16   26   36   46   56   66   76   86    96
 [7,]    7   17   27   37   47   57   67   77   87    97
 [8,]    8   18   28   38   48   58   68   78   88    98
 [9,]    9   19   29   39   49   59   69   79   89    99
[10,]   10   20   30   40   50   60   70   80   90   100



     for (i in nrow(mymatrix)){
           vector1 <- c(mymatrix[i,1:5]) 
            vector2 <- c(mymatrix[i,6:10])
             wilcox.test(vector1,vector2, paired = TRUE, alternative = "two.sided")
         }

    #Warning message:
    In wilcox.test.default(vector1, vector2, paired = TRUE, alternative = "two.sided") :
    cannot compute exact p-value with ties

    # I also tried this, it doesn't work either.

 for (i in nrow(mymatrix)){
  wilcox.test(as.numeric(mymatrix[i,1:5],as.numeric(mymatrix[i,6:10]), paired = TRUE)
 }

딥시 팬

다음과 같은 것을 찾고 있습니다.

# initialize a list to store the p_values
p_values <- vector("list", nrow(mymatrix))

for(i in seq_along(1: nrow(mymatrix))){
  p_values[i] = wilcox.test(mymatrix[i,1:5],mymatrix[i,6:10], paired = TRUE, alternative = "two.sided", exact = FALSE)$p.value

}
# make it a data.frame
p_values = data.frame(p_values = sapply(p_values, c))
#Output
p_values

#     p_values
# 1  0.03688843
# 2  0.03688843
# 3  0.03688843
# 4  0.03688843
# 5  0.03688843
# 6  0.03688843
# 7  0.03688843
# 8  0.03688843
# 9  0.03688843
# 10 0.03688843

도움이되기를 바랍니다.

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침해가 발생한 경우 연락 주시기 바랍니다[email protected] 삭제

에서 수정2021-04-1

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