R knitr : R 및 Python 코드와 함께 spin () 사용

의 사용은 reticulate::source_python하나의 해결책이 될 수 있습니다.

예를 들어 다음은 .Rmd로 회전 한 다음 .html로 렌더링되는 간단한 .R 스크립트입니다.

스핀 미 R

#'---
#'title: R and Python in a spin file.
#'---
#'
#' This is an example of one way to write one R script, containing both R and
#' python, and can be spun to .Rmd via knitr::spin.
#'
#+ label = "setup"
library(nycflights13)
library(ggplot2)
library(reticulate)
use_condaenv()

#'
#' Create the file flights.csv to
#'
#+ label = "create_flights_csv"
write.csv(flights, file = "flights.csv")

#'
#' The file flights.py will read in the data from the flights.csv file.  It can
#' be evaluated in this script via source_python().  This sould add a data.frame
#' called `py_flights` to the workspace.
source_python(file = "flights.py")

#'
#' And now, plot the results.
#'
#+ label = "plot"
ggplot(py_flights) + aes(carrier, arr_delay) + geom_point() + geom_jitter()


# /* spin and knit this file to html
knitr::spin(hair = "spin-me.R", knit = FALSE)
rmarkdown::render("spin-me.Rmd")
# */

파이썬 파일은

flights.py

import pandas
py_flights = pandas.read_csv("flights.csv")
py_flights = py_flights[py_flights['dest'] == "ORD"]
py_flights = py_flights[['carrier', 'dep_delay', 'arr_delay']]
py_flights = py_flights.dropna()

결과 .html의 화면 캡처는 다음과 같습니다.

편집 모든 것을 하나의 파일에 보관해야하는 경우 source_python호출 하기 전에 파이썬 파일을 만들 수 있습니다. 예 :

pycode <-
'import pandas
py_flights = pandas.read_csv("flights.csv")
py_flights = py_flights[py_flights["dest"] == "ORD"]
py_flights = py_flights[["carrier", "dep_delay", "arr_delay"]]
py_flights = py_flights.dropna()
'
cat(pycode, file = "temp.py")
source_python(file = "temp.py")

내 의견 : 파이썬 코드를 자체 파일에 포함하는 것이 두 가지 이유로 R 스크립트에서 생성하는 것보다 낫습니다.

1. 파이썬 코드의 더 쉬운 재사용
2. 내 IDE의 구문 강조 표시는 자체 파일이 아닌 문자열로 작성 될 때 파이썬 코드에서 손실됩니다.