ファイルのリストをコピーして順番に続行するにはどうすればよいですか（ファイル1 =ファイルn + 1、2 = n + 2など）？

各ファイル名の数値を1000ずつインクリメントし、残りはそのままにしておくには、正規表現を使用できます。

re='(.*-)([[:digit:]]+)(.*)'
for f in file*; do
    [[ $f =~ $re ]]
    echo mv "$f" "${BASH_REMATCH[1]}$(( ${BASH_REMATCH[2]} + 1000 ))${BASH_REMATCH[3]}"
done

結果が希望どおりの場合は、を削除できますecho。

または、Perlrenameツールをお持ちの場合は、

rename -n 's/\d+/$&+1000/e' file-*

-n置換が問題ないようになったら削除します。これはrename、util-linuxプロジェクトのツールでは機能しないことに注意してください。