ggplot2で複数のレイヤーをプロットする

debugcn 投稿 Dev

rnd

ggplot2 "geom_raster"関数を使用して、2つのdata.frameを2つのレイヤーとしてプロットしようとしています。最上層には、下層を表示するために「透明」に設定されたNA値が含まれています。scale_fill_xxx関数は2回使用できないため、次のコードを試しました（この投稿に基づく：ggplot2-オーバーレイされたプロットに2つの異なるカラースケールを使用）：

library(ggplot2)

df1 <- data.frame(x=rep(c(1,2,3),times=3), y=c(1,1,1,2,2,2,3,3,3), data= c(NA,4,9,NA,2,7,NA,NA,3))
df2 <- data.frame(x=rep(c(1,2,3),times=3), y=c(1,1,1,2,2,2,3,3,3), data= c(1,NA,NA,2,NA,NA,1,2,NA))

ggplot() + 
geom_raster(data=df1, aes(y= y, x= x, fill= data)) + 
scale_fill_gradientn(name="df1", colours=c("red", "blue"), na.value = "transparent") + 
geom_raster(data= df2, aes(y= y, x= x, colour= as.factor(data))) + 
scale_colour_manual(values = c("green", "black"), name= "df2", labels= c("Class 1", "Class 2"), na.value="transparent")

問題は、「colour」/「scale_colour_manual」ソリューションが私が期待するものを返さないことです（代わりに濃い灰色のプロットを返します）。df1の「データ」列を赤から青のスケールで表し（NAは透明である必要があります）、df2の「データ」列をクラス番号（「1」=緑および「2」=黒）で表すようにします。）。

誰かが私の手順の何が問題になっているのかを理解するのを手伝ってもらえますか？

bVa

ここに解決策があります：

df3 = merge(df1, df2, by = c("x","y"))
names(df3)[names(df3) == "data.x"] <- "data.1"
names(df3)[names(df3) == "data.y"] <- "data.2"
df3$data = df3$data.1
df3$data[is.na(df3$data)] = df3$data.2[is.na(df3$data)]

myGrad <- colorRampPalette(c('blue','red')) # color gradient
min_value = min(df3$data[df3$data >2]) # minimum value except 1 and 2
max_value = max(df3$data) # maximum value 
param = max_value - min_value + 1 # number of colors in the gradient


ggplot(df3, aes(x, y, fill = data)) + geom_raster() + 
scale_fill_gradientn(colours=c("green","black", myGrad(param)), 
values = rescale(c(1, 2, seq(min_value, max_value, 1))), na.value = "transparent")

私はあなたがより高い値と範囲でこのプロットを使うと思います、私は5x5マトリックスで試しました：

set.seed(123)
df4 = data.frame(x=rep(c(1,2,3,4,5),5), y=c(rep(1,5), rep(2,5), rep(3,5), rep(4,5), rep(5,5)), 
data = sample(c(1:20), 25, prob = c(0.2,0.2,rep(0.6/18,18)), replace = T))
min_value = min(df4$data[df4$data >2])
max_value = max(df4$data)
param = max_value - min_value + 1 

ggplot(df4, aes(x, y, fill = data)) + geom_raster() + 
scale_fill_gradientn(colours=c("green","black", myGrad(param)), 
values = rescale(c(1, 2, seq(min_value, max_value, 1))), na.value = "transparent")