他の列で定義されたサブセットに基づいて、複数の列のグループごとに中央値を計算しようとしています(ただし、同様のメトリックで置き換えることができます)。これは、私の以前の投稿からの直接の後続の質問です。@Frankから提供さaggregate
れたMap(function(x,y) dosomething, x, y)
ソリューションに、viaの中央値の計算を組み込むことを試みましたが、うまくいきませんでした。説明させてください:
グループGRP1とGRP2によってAとBの中央値を計算します
df <- data.frame(GRP1 = c("A","A","A","A","A","A","B","B","B","B","B","B"), GRP2 = c("A","A","A","B","B","B","A","A","A","B","B","B"), A = c(0,4,6,7,0,1,9,0,0,8,3,4), B = c(6,0,4,8,6,7,0,9,9,7,3,0))
med <- aggregate(.~GRP1+GRP2,df,FUN=median)
シンプル。次に、中央値の計算に使用する行を定義する列を追加します。つまり、NAのある行を削除する必要があります。列aは、列BとBの場合と同じように、列Aの中央値の計算に使用する行を定義します。
a <- c(1,4,7,3,NA,3,7,NA,NA,4,8,1)
b <- c(5,NA,7,9,5,6,NA,8,1,7,2,9)
df1 <- cbind(df,a,b)
前述したように、私は組み合わせる試みているMap
とaggregate
、それは動作しませんでした。私はそれMap
がGRP1とGRP2をどうするかわからないと思います。
med1 <- Map(function(x,y) aggregate(.~GRP1+GRP2,df1[!is.na(y)],FUN=median), x=df1[,3:4], y=df1[, 5:6])
これは私が探している結果です:
GRP1 GRP2 A B
1 A A 4 5
2 B A 9 9
3 A B 4 7
4 B B 4 3
どんな助けでも大歓迎です!
使用する data.table
library(data.table)
setDT(df1)
df1[, .(A = median(A[!is.na(a)]), B = median(B[!is.na(b)])), by = .(GRP1, GRP2)]
GRP1 GRP2 A B
1: A A 4 5
2: A B 4 7
3: B A 9 9
4: B B 4 3
の同じロジック dplyr
library(dplyr)
df1 %>%
group_by(GRP1, GRP2) %>%
summarise(A = median(A[!is.na(a)]), B = median(B[!is.na(b)]))
オリジナルdf1
:
df1 <- data.frame(
GRP1 = c("A", "A", "A", "A", "A", "A", "B", "B", "B", "B", "B", "B"),
GRP2 = c("A", "A", "A", "B", "B", "B", "A", "A", "A", "B", "B", "B"),
A = c(0, 4, 6, 7, 0, 1, 9, 0, 0, 8, 3, 4),
B = c(6, 0, 4, 8, 6, 7, 0, 9, 9, 7, 3, 0),
a = c(1, 4, 7, 3, NA, 3, 7, NA, NA, 4, 8, 1),
b = c(5, NA, 7, 9, 5, 6, NA, 8, 1, 7, 2, 9)
)
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