如何使用ggplot2将标准误差线添加到箱形图和晶须图中?

詹瑟

我正在尝试向我的数据添加标准误差线,类似于在该问题答案的结尾附近的方框图中看到的误差线:https : //stats.stackexchange.com/questions/8137/how-to-add水平线到ggplot2-boxplot

我正在使用PlantGrowth数据集,它看起来像这样(除了总共30行长):

    weight    group
1   4.17      ctrl
2   5.58      ctrl
3   4.81      trt1
4   4.17      trt1
5   6.31      trt2
6   5.12      trt2

我已经制作了这个情节

这个情节

用下面的代码

 ggplot(PlantGrowth, aes(group, weight))+
stat_boxplot(geom='errorbar', linetype=1, width=0.5)+  #whiskers
geom_boxplot(outlier.shape=1)+    
stat_summary(fun.y=mean, geom="point", size=2)   #dot for the mean

我不知道如何基于该因子变量中的变化为每个图添加误差线。我已经添加了,+geom_errorbar(aes(x=group, ymin=mean-sd, ymax=mean+sd))但是它返回错误“均值错误-sd:二进制运算符的非数字参数”

任何帮助,将不胜感激。谢谢

事物

mean_seggplot2中有一个功能完全可以满足您的需求。

library(ggplot2)
ggplot(PlantGrowth, aes(group, weight))+
  stat_boxplot( aes(group, weight), 
    geom='errorbar', linetype=1, width=0.5)+  #whiskers
  geom_boxplot( aes(group, weight),outlier.shape=1) +    
  stat_summary(fun.y=mean, geom="point", size=2) + 
  stat_summary(fun.data = mean_se, geom = "errorbar")

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