我试图在python中使用hmmlearn拟合隐藏的Markov模型。我假设我的数据格式不正确,但是对于hmmlearn来说,文档很浅。直观地,我会将数据格式化为n_observations x n_time_points x n_features的3维数组,但是hmmlearn似乎想要一个2d数组。
import numpy as np
from hmmlearn import hmm
X = np.random.rand(10,5,3)
clf = hmm.GaussianHMM(n_components=3, n_iter=10)
clf.fit(X)
出现以下错误:
ValueError: Found array with dim 3. Estimator expected <= 2.
有谁知道如何格式化数据以构建我要使用的HMM?
注意:以下所有内容都与当前未发布的的0.2.0版本有关hmmlearn
。PyPI上可用的0.1.0版本使用从继承的其他API sklearn.hmm
。
为了使模型适合多个序列,您必须提供两个数组:
X
---来自所有序列的数据的串联, lengths
---序列长度的数组。我将通过一个示例来说明这些约定。考虑两个一维序列
X1 = [1, 2, 0, 1, 1]
X2 = [42, 42]
为了将两个序列都传递给.fit
方法,我们需要先将它们连接成一个数组,然后计算一个长度数组
X = np.append(X1, X2)
lengths = [len(X1), len(X2)]
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