我真的是R和这个论坛的新手,并且需要构建循环的帮助。(我是一名生物学专业的学生,几乎没有编程经验)。
我的数据框具有以下(简化的)结构:
a = "TNS"
b = NA
c = NA
d = 21
e = 37
f = 1
g = 39
h = 29
df = data.frame (a,b,c,d,e,f,g,h)
实际上,我的数据框由210行和90列组成,但是我现在对那些其他行并不真正感兴趣。我正在寻找的一种方法是对除前三个之外的每个其他列的值求和,并将这些结果作为新列自动添加到我的数据帧的末尾。这将优先产生一个data.frame,如下所示:
a = "TNS"
b = NA
c = NA
d = 21
e = 37
f = 1
g = 39
h = 29
de = 58
df = 22
dg = 60
dh = 50
ef = 38
eg = 76
eh = 66
fg = 40
fh = 30
gh = 68
df = data.frame (a,b,c,d,e,f,g,h,de,df,dg,dh,ef,eg,eh,fg,fh,gh)
每个列不能多次配对。为每个配对运行循环后,我需要对每个三元组列,四重奏列等进行处理。
我为什么要这样做?对于一个生物多样性研究项目,我需要为85列进行此操作,而要手工计算每种组合的价值将花费太多时间。
任何帮助将不胜感激,因为我真的没有R的经验,无法自己提出解决方案!!!
您可以将combn
与结合使用rowSums
,如下所示:
## This creates the names for the new columns we'll be creating
nam <- combn(names(df)[-c(1, 2, 3)], 2, FUN = function(x) paste(x, collapse = ""))
## Create and assign to your original data.frame
df[nam] <- combn(names(df)[-c(1, 2, 3)], 2,
FUN = function(x) rowSums(df[x], na.rm = TRUE), simplify = FALSE)
df
# a b c d e f g h de df dg dh ef eg eh fg fh gh
# 1 TNS NA NA 3 3 10 5 9 6 13 8 12 13 8 12 15 19 14
# 2 TNS NA NA 4 2 3 6 7 6 7 10 11 5 8 9 9 10 13
# 3 TNS NA NA 6 7 7 5 8 13 13 11 14 14 12 15 12 15 13
# 4 TNS NA NA 10 4 2 2 6 14 12 12 16 6 6 10 4 8 8
# 5 TNS NA NA 3 8 3 9 6 11 6 12 9 11 17 14 12 9 15
# 6 TNS NA NA 9 5 4 7 8 14 13 16 17 9 12 13 11 12 15
# 7 TNS NA NA 10 8 1 8 1 18 11 18 11 9 16 9 9 2 9
# 8 TNS NA NA 7 10 4 2 5 17 11 9 12 14 12 15 6 9 7
# 9 TNS NA NA 7 4 9 8 8 11 16 15 15 13 12 12 17 17 16
# 10 TNS NA NA 1 8 4 5 7 9 5 6 8 12 13 15 9 11 12
这是用于此答案的样本数据:
set.seed(1)
df <- data.frame(a = "TNS", b = NA, c = NA,
matrix(sample(10, 50, TRUE), ncol = 5,
dimnames = list(NULL, c("d", "e", "f", "g", "h"))))
df
# a b c d e f g h
# 1 TNS NA NA 3 3 10 5 9
# 2 TNS NA NA 4 2 3 6 7
# 3 TNS NA NA 6 7 7 5 8
# 4 TNS NA NA 10 4 2 2 6
# 5 TNS NA NA 3 8 3 9 6
# 6 TNS NA NA 9 5 4 7 8
# 7 TNS NA NA 10 8 1 8 1
# 8 TNS NA NA 7 10 4 2 5
# 9 TNS NA NA 7 4 9 8 8
# 10 TNS NA NA 1 8 4 5 7
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