我想从标识符列表中删除字符串中的小数位:
ENSG00000166224.12
ENSG00000102897.5
ENSG00000168496.3
ENSG00000010295.15
ENSG00000147533.12
ENSG00000119242.4
我想要的输出将是
ENSG00000166224
ENSG00000102897
ENSG00000168496
ENSG00000010295
ENSG00000147533
ENSG00000119242
我想用awk来做,我一直在玩printf
但没有成功。
更新:
awk答案将字段分隔符设置为.
在只有一列的文件中很好地工作,但是如果文件由不同的列(字符串和浮点数)组成怎么办?这是一个例子:
ENSG00000166224.12 0.0730716237772557 -0.147970450702234
ENSG00000102897.5 0.156405616866614 -0.0398488625782745
ENSG00000168496.3 -0.110396121325736 -0.0147093758392248
如何只删除第一个字段中的小数位?
谢谢
您可以将字段分隔符设置为点并打印第一个元素:
$ awk -F. '{print $1}' file
ENSG00000166224
ENSG00000102897
ENSG00000168496
ENSG00000010295
ENSG00000147533
ENSG00000119242
在sed
你会说sed 's/\.[^\.]*$//' file
,这将捕获一切从最后的点,将其取下。
printf
如果只是个数字,您将可以使用它。然后,您将使用某种方式不打印小数位。但是,由于它是字母数字字符串,因此最好将其作为字符串处理。
使用gsub
从取代一切.
的第一个字段:
$ awk '{gsub(/\..*$/,"",$1)}1' a
ENSG00000166224 0.0730716237772557 -0.147970450702234
ENSG00000102897 0.156405616866614 -0.0398488625782745
ENSG00000168496 -0.110396121325736 -0.0147093758392248
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