我使用R来运行一些非常密集的C代码（R包装器）。因此，我想在群集上运行.R文件。我曾经使用.pbs文件从群集上的C代码运行可执行文件，如下所示：
#!/bin/bash
#PBS -l procs=1
#PBS -l walltime=240:00:00
#PBS -N Name
#PBS -m ea
#PBS -M [email protected]
#PBS -l pmem=1000mb
#PBS -t 1-3
echo "Starting run at: `date`"
path/to/myscript
echo "Job finished with exit code $? at: `date`"
我可以使用.R文件制作可执行文件并像编译C代码一样运行它吗？如何编译.R文件？
我猜您将在Linux / UNIX OS下使用脚本。如果是这种情况，请#! /usr/bin/env Rscript在您的R脚本中添加一个shebang并将其设置为可执行文件chmod u+x path/to/myscript。您无需编译代码。
请注意，您可能需要module load R在PBS脚本中添加类似内容以加载R环境变量。
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