我目前正在为GitHub上托管的R包编写文档。我knitr与R Markdown一起使用来编写自述文件。在RStudio中点击“编织HTML”按钮会产生一个HTML，就像我期望的那样。
但是，将README.rmd推送到GitHub时，将显示在上述链接后的下一页部分。例如，最高代码块在README.rmd文件中声明如下：
```{r global_options, include = FALSE}
library(knitr)
options(width = 120)
opts_chunk$set(fig.width = 12, fig.height = 8, fig.path = 'Figs/',
include = TRUE, warning = FALSE, message = FALSE)
```
但是，include = FALSE在这种情况下，仅会忽略第一行代码中的语句，并且应该隐藏的代码段会显示在引用的GitHub页面上。此外，尽管，结果（例如plot()，head()）无法显示opts_chunk$set(..., include = TRUE)。
有没有人遇到类似的问题，我是否可以帮助我在GitHub上正确显示我的README文档（即RStudio处理它的方式）？
您尝试在github上发布的自述文件应该是普通的markdown文档，即.md文件，而不是raw文件.rmd。因此，首先.rmd要用knitr（在R内）编织，如下所示：
knit(input="readme.rmd", output = "readme.md") #see ?knit for more options
这将评估源中指定的全局和块选项，.rmd并产生.md相应格式的github可以轻松呈现的格式。
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