我想将file2的第二列与file1的第一列进行比较。如果它们相等，我想将file1的第二列添加到file2，如output.txt所示。
文件2
chr5 ENST00000514151 utr5 0 +
chr5 ENST00000512281 utr5 0 +
chr5 ENST00000512281 utr5 0 +
chr5 ENST00000512281 utr5 0 +
文件1
ENST00000512281 a
ENST00000504031 b
ENST00000776348 c
output.txt
chr5 a ENST00000512281 utr5 0 +
chr5 a ENST00000512281 utr5 0 +
chr5 a ENST00000512281 utr5 0 +
我可以比较文件
awk 'NR==FNR{a[$1];next}$2 in a{print}' file1 file2
这给出以下输出：
chr5 ENST00000512281 utr5 0 +
chr5 ENST00000512281 utr5 0 +
chr5 ENST00000512281 utr5 0 +
但是我不知道如何将file1的第二列添加到输出中。
您可以使用将$2in的值存储file1到数组中a[$1]=$2。因此，您可以尝试：
awk '
NR==FNR{
a[$1]=$2 ; next }
$2 in a {
$1=$1 FS a[$2]
print
}' file1 file2
输出：
chr5 b ENST00000504031 utr5 0 +
chr5 b ENST00000504031 utr5 0 +
chr5 a ENST00000512281 utr5 0 +
chr5 a ENST00000512281 utr5 0 +
chr5 a ENST00000512281 utr5 0 +
说明：
$1，该分隔符是一个空格..然后重建记录，以便以后可以打印。file2$1=$1 FS a[$2]FSprintprint可以将其简化为1。$2 in a { $1=$1 FS a[$2] }1file2，因此任何空格或制表符序列都将被截断为输出中的单个空格。要使原始格式保持file2一种格式，可以使用split()Gnu Awk版本4中的功能。本文收集自互联网，转载请注明来源。
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