我有一个翻译表 ( trans_df)：
trans_df <- read.table(text = "rs1065852 rs201377835 rs28371706 rs5030655 rs5030865 rs3892097 rs35742686 rs5030656 rs5030867 rs28371725 rs59421388
G C G A C C T CTT T C C
G C G A C C del CTT T C C
A C G A C T T CTT T C C
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G C G del C C T CTT T C C
G C G A C C T CTT G C C
G C G A C C T del T C C
A C G A C C T CTT T C C
G C A A C C T CTT T C C
G C G A C C T CTT T C T
G C G A C C T CTT T T C",header=TRUE, stringsAsFactors = FALSE, colClasses = "character")
和input：
input <- read.table(text = "rs1065852 rs201377835 rs28371706 rs5030655 rs5030865 rs3892097 rs35742686 rs5030656 rs5030867 rs28371725 rs59421388
+ G|A C G|A A C T|C T CTT T C|T C", header = TRUE, stringsAsFactors = FALSE, colClasses = "character")
我想使用正则表达式在 trans_df 中找到输入行。我通过职位实现了它：
Reduce(intersect,lapply(seq(1, ncol(trans_df)),
function(i) {grep(pattern = input[, i],
trans_df[, i])}))
有什么方法可以在模式 = 输入的情况下做到这一点？请指教。
你可以用它Map来实现，即
Map(grep, input, trans_df)
但是，这假设您的列是一对一匹配的。如果那不成立，那么您可以使用match使它们相同，即
Map(grep, input[match(names(input), names(trans_df))], trans_df)
#or in the same sense and to keep input intact,
Map(grep, input, trans_df[match(names(trans_df), names(input))])
但是，我认为这会超出您的目的。
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