在程序的这一部分中，我现在将一个普通的字母序列转换为fasta格式。我需要采用这种fasta格式并以文件形式放置，以便可以将其发送到程序中，该程序将在代码的后面发布。在第3行中，我创建了“ fasta.txt”。我需要在该文件中放入第8行fastaform的输出。在最后一行中，我尝试执行此操作，但没有成功，我也不知道该如何做。我觉得这应该很简单，但是我是新手。
infname = sys.argv[2]
handle = open(infname, "r")
file = open("fasta.txt", "w")
for line in handle:
linearr = line.split()
seqid = linearr[0]
seq = linearr[1]
fastaform = (">%s\n%s\n" % (seqid,seq))
print fastaform >> "fasta.txt"
尝试
file.write(fastaform)
file.close()
本文收集自互联网，转载请注明来源。
如有侵权，请联系[email protected] 删除。
我来说两句