从关机脚本调用的pdflatex / lualatex无法找到已安装的软件包

在工作中，我已在Ubuntu 14.04.1计算机上设置了一个小备份脚本。该脚本将我的计算机备份到外部硬盘驱动器。完成此操作后，它将LaTeX项目复制到我的Dropbox并进行编译。这个项目是我工作的日志。

我知道这是一个非常常规的用例，我可以复制源代码或将其推送到git repo，但首先git会有点过大，其次我已经很高兴有两个实例了当我不得不启动tty shell时（因为gnome无法启动），在手机上以pdf格式显示它。

现在的问题是，由于某种原因，pdflatex和lualatex都告诉我它们找不到.sty文件。备份脚本如下：

#!/bin/bash

# .... some system backup code ....

## sync linux setup document to Dropbox
# remove .pdf in order to guarantee that project is compiled
rm /home/user/Documents/LaTeX/logBook/logBook.pdf
# compile project in origin 
make -C /home/user/Documents/LaTeX/logBook/ >> /home/user/Documents/LaTeX/logBook/makeLog
# copy files to destination
cp -rp /home/user/Documents/LaTeX/logBook/ /home/wright/Dropbox

并且我Makefile包含以下几行：

SHELL=bash
TARGET=linuxSetup.pdf
FLAGS= --shell-escape
SRC= ./*.tex ./header/*.tex  ./chapters/*.tex ./references/*.bib ./titlepage/*.tex 
TIKZ= ./tikz/*.tex
LL= pdflatex


all: $(TARGET)

$(TARGET): $(TARGET:%.pdf=%.tex) $(SRC) $(TIKZ)
    @$(LL) $(FLAGS) $<
#   makeglossaries $(TARGET:%.pdf=%"")
#   makeindex -s headingsStyle.ist $(TARGET:%.pdf=%.idx)
#   bibtex $(TARGET:%.pdf=%"")
    @$(LL) $(FLAGS) $<
    @$(LL) $(FLAGS) $<

备份脚本放置在中，/etc/init.d/backup并包含指向的符号链接/etc/rc0.d/S01Backup。

脚本很简单，但是仍然找不到.sty文件。我试图排除.sty文件，以找出问题是否是由特定文件引起的，但是无论我排除了多少文件，总会有更多编译器找不到的文件。我切换了编译器，但这似乎也不是问题。另外，我sudo以root用户身份或以root用户身份执行了完整的备份脚本，两者都工作得很好，没有任何错误。

我想念什么？

编辑：这是输出的最后一位：

(/usr/share/texlive/texmf-dist/tex/latex/amsmath/amstext.sty
(/usr/share/texlive/texmf-dist/tex/latex/amsmath/amsgen.sty))
(/usr/share/texlive/texmf-dist/tex/latex/amsmath/amsbsy.sty)
(/usr/share/texlive/texmf-dist/tex/latex/amsmath/amsopn.sty))
(/usr/share/texlive/texmf-dist/tex/latex/cite/cite.sty)
(/usr/share/texlive/texmf-dist/tex/latex/mh/empheq.sty
(/usr/share/texlive/texmf-dist/tex/latex/mh/mhsetup.sty)
(/usr/share/texlive/texmf-dist/tex/latex/mh/mathtools.sty
(/usr/share/texlive/texmf-dist/tex/latex/tools/calc.sty)))
(/usr/share/texlive/texmf-dist/tex/latex/etex-pkg/etex.sty)
(/usr/share/texlive/texmf-dist/tex/latex/fancybox/fancybox.sty
Style option: `fancybox' v1.4 <2010/05/15> (tvz)
) (/usr/share/texlive/texmf-dist/tex/latex/float/float.sty)

! LaTeX Error: File `floatflt.sty' not found.

Type X to quit or <RETURN> to proceed,
or enter new name. (Default extension: sty)

Enter file name: 

floatflt.sty有问题的文件位于texlive安装目录中/usr/local/texlive/2015/texmf-dist/tex/latex/floatflt。但是，它在上面找到的其他软件包位于中/usr/share/texlive/texmf-dist/tex/latex/<packagename>。