R中的累积曲线

debugcn 发表于 Dev

MyNameisTK

我有几个月的时间在4个地点的物种数据。我已经使用veganR中的包成功创建了累积图，但是我想在一个图上绘制所有4个站点。

最初，我有一个包含所有站点和月份的数据表，但是当我绘制specaccum结果时，无论位置如何，结果都是所有数据的累积曲线。

因此，我将每个站点拆分到一个单独的数据表中，然后将其加载到R中。在每个数据表中，第一行是物种名称，下面的每个其他行是一个月。

例如，我加载了我的网站“ FMR”之一的数据。然后，我执行了以下操作：

FMR <-specaccum(FMRJ2F, "random")
plot(FMR)

我也同样对我的其他网站，PP，DUX，PM。如何将所有4条线放在一个图上？

耶洛华德

您可以只在其中使用add=T参数plot.specaccum(...)

library(vegan)
data(BCI) 
df <- lapply(c(1,21,41,61,81),function(i)specaccum(BCI[,seq(i,i+19)], method="random"))
plot(df[[1]])
for (i in 2:5) plot(df[[i]],add=T, col=i)

此代码段仅将内置的BSI数据集加载到中vegan，并specaccum通过specaccum(...)在BCI中的列的子集上运行来创建5个对象的列表。因为您已经有了specaccum对象，所以您不需要这样做。

然后，我们创建第一个图，并使用添加每个新曲线add=T。

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编辑于2021-06-5

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