如何在pROC中的multiclass.roc图中添加标题?

加尔帕克鲁

我有一个nnet:multinom由5个类构成的用于26个变量的多项式模型

mirna_multinom_0 = multinom(formula_0, data= clase_training, maxit=10000 )

然后,我使用以下命令创建ROCS:

multiclass.roc(clase_training$clase, mirna_multinom_0$fitted.values,plot=TRUE)

我情节。

pred_test_inter_multinom_5 = predict(interaction_multinom_model_5, newdata = clase_test, "probs")
multiclass.roc(clase_test$clase, pred_test_inter_multinom_5,plot=TRUE)

第一次对比Ctrl vs Group1的图

为了理解它们,我将其存储为一个对象e并将其称为对比,names(e$roc)以查看对比。

e = multiclass.roc(clase_training$clase, mirna_multinom_0$fitted.values)
names(e$rocs)

 [1] "Control/Idiop_grave"      "Control/Idiop_leve"       "Control/Isquem_grave"    
 [4] "Control/Isquem_leve"      "Idiop_grave/Idiop_leve"   "Idiop_grave/Isquem_grave"
 [7] "Idiop_grave/Isquem_leve"  "Idiop_leve/Isquem_grave"  "Idiop_leve/Isquem_leve"  
[10] "Isquem_grave/Isquem_leve"

这给了我每个图2个图,一个在>方向,另一个在<方向。

现在。我可以以某种方式在绘图中绘制每个对比的标题吗?

而且,是否有一种方法可以获取每个ROC对比度的曲线AUC下的面积?我仅在有关多项式的消息中获得它。Wich没有PROC图。我能否获得多项式ROC,或者仅获得其无图形表示的构造?

冷静

我可以以某种方式在绘图中绘制每个对比的标题吗?

您将需要自己遍历曲线,但是可以轻松完成,例如:

for (contrast in names(e$rocs)) {
    plot(e$rocs[[contrast]][[1]], col = "green", main = contrast)
    plot(e$rocs[[contrast]][[2]], col = "blue", add = TRUE)
}

有没有一种方法可以针对每种ROC对比度获取曲线AUC下的面积?

您可以使用该auc功能执行类似的操作

for (contrast in names(e$rocs)) {
    print(contrast)
    print(auc(e$rocs[[contrast]][[1]]))
    print(auc(e$rocs[[contrast]][[2]]))
}

我能否获得多项式ROC,或者仅获得其无图形表示的构造?

这是Hand&Till在doi:10.1023 / A:1010920819831中描述的AUC平均值没有相应的曲线可表示。

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